Ethan Hunt'ın Solomon Lane'i başarılı bir şekilde ele geçirmesinden iki yıl sonra, Sendikanın kalıntıları, yakalanması zor aşırılık yanlısı John Lark'ın liderliğindeki esrarengiz Havariler olarak yeniden bir araya geldi. Yeni hedefleri: Üç ölümcül plütonyum çekirdeğini ele geçirmek. Berlin'e gönderilen Ethan'ın ekibi, çekirdekleri ele geçirmeye çalışır, ancak Ethan, Luther'i kurtarmaya öncelik vererek Havarilerin plütonyumla birlikte ortadan kaybolmasına izin verince görevleri sekteye uğrar. CIA ajanı August Walker'ın da dahil olmasıyla Ethan ve müttefikleri, yıkıcı bir felaket ortaya çıkmadan önce plütonyum çekirdeklerinin yerini belirlemek için zamana karşı bir yarışla karşı karşıya kalır.